La audiencia ante la Corte Suprema de Justicia por la limpieza del Riachuelo dejó al descubierto que las medidas tomadas no alcanzan. En este sentido el secretario de Ambiente de la Nación, Juan José Mussi encontró en Gustavo Villa Uría al responsable y su alejamiento como presidente ejecutivo de la Acumar es inminente.

También aseguran que los cambios en el organismo afectarán a otros funcionarios. Los  avances en el plan de saneamiento, no terminaron de convencer a los miembros de la Corte. Villa Uría habría afirmado que "hay menos basura superficial y flotante, lo cual permite que aparezcan ciertas aves, que se alimentan de peces que en cierto momento pueden entrar en el Riachuelo en circunstancias difíciles porque todavía la contaminación es muy fuerte. Hay peces en el tramo Matanza y aguas arriba del cruce de la ruta 4 con la Ricchieri, podemos encontrar humedales, como el bañado de Rocha, donde hay más de 200 especies detectadas”
Pocos avances, escaso relevamiento de datos, política endeble en salud, inspecciones en cámara lenta y falta de información quedaron al descubierto. Unas 10.000 mil industrias es el universo que aún quedan si controlar, y las falencias llevan a que unas 130 tengan algún plan de reconversión. Mussi intentó demostrar avances pero los números contrastaron. Incluso el informe de la Auditoría General de la Nación indica que en el  primer semestre del año 2010 sobre la asignación de fondos y la ejecución presupuestaria de la Autoridad de Cuenca Matanza Riachuelo (ACUMAR), representa el 18%, detallándose en el mismo que este bajo porcentaje no es atribuible a la insuficiencia de las cuotas otorgadas para devengar el gasto. Leandro Despouy, presidente de la Auditoría General de la Nación (AGN) planteó "problemas fundamentales y de fondo que le dificultan enormemente la labor de control" y puso como ejemplo la falta de identificación adecuada de las partidas presupuestarias. Por su parte el defensor del Pueblo,  Anselmo Sella, reconoció las "líneas de acción para trabajos conjuntos" que realiza con la Acumar aunque consideró necesario profundizar políticas "para que los derechos ambientales puedan ejercerse plenamente". Ahora el máximo tribunal tiene previsto realizar una inspección ocular en la cuenca para observar el real avance del plan de saneamiento.