Las reservas en Misiones se encuentran en estado de indefensión. Recientemente se conoció que la Reserva Privada Yaguaroundi reclamó la intervención del Ministerio de Ecología, Recursos Naturales Renovables y Turismo de Misiones, para que envíe controles tal como corresponde a la institución gubernamental para evitar la caza furtiva. A su vez los propietarios manifestaron que es posible que se tomen represalias. La reserva privada de 400 hectáreas tiene un convenio con la provincia desde el año 1999 y se incluye en los esfuerzos privados para mantener condiciones de representatividad del territorio. Estos convenios incluyen una potestad indeclinable de protección por parte del citado ministerio. Sin embargo la presencia de controles “es nula” explicaron autoridades de la reserva. En la reserva se han hallado saleros, perros de jauría, cebaderos, senderos abiertos y restos de cartuchos de escopeta.

Tampoco lograron la intervención de la Gendarmería Nacional pese a haber realizado constantes exposiciones policiales. 
“Veo con suma preocupación la ausencia de colaboración y control mínimo de las áreas protegidas provinciales, y en particular de la Reserva Yaguaroundi, que mantiene convenio con la Provincia desde 1999” dijo el abogado Franco Vacarezza.
Para Vacarezza “no sólo está en peligro el patrimonio natural de Misiones, está en peligro la integridad física de las personas que custodian el área, por lo que los hago directos responsables  por los daños de toda índole que padece el área y que eventualmente pudieren sufrir visitantes, guardaparques y propietarios”.
A la fecha desde el organismo no se respondió al reclamo efectuado, salvo un mail enviado por el el Director de Áreas Protegidas Miguel Azarmendia que sostuvo no contar con recursos. Este panorama deja en estado de indefensión a todas las reservas de la provincias sea cual fuera el status de la misma. Llama la atención que esto ocurra ya que el ministro de Ecología, Recursos Naturales Renovables y Turismo de Misiones, Horacio Blodek, tiene a su cargo la titularidad de la comisión de Bosques Nativos del Consejo Federal de Medioambiente (COFEMA). Blodek al inicio de su gestión había prometido reconvertir a la provincia en materia de protección ambiental y bosques. Lo prometido quedó en el olvido salvo la ocurrencia de lanzar un parque provincial acuático en el Parque Nacional Iguazú. A su vez bastó que se reglamentara la ley de protección de los bosques nativos, que establece el ordenamiento territorial en las provincias, para que la sociedad comenzara una lenta pero lineal marcha hacia la participación en la aplicación de la norma. En Misiones diversos sectores sociales, desde el ambientalismo hasta los pueblos originarios, pidieron al Ministro de Ecología, Recursos Naturales y Turismo, Horacio Blodek, participar activamente en el proceso de elaboración del proyecto de Ley Provincial de Ordenamiento Territorial de los Bosques Nativos de Misiones. Salvo algunos talleres esporádicos la idea es presentar el ordenamiento con la menor participación pública. Hace un mes el secretario de Ambiente y Desarrollo Sustentable de la Nación, Homero Bibiloni y el ministro Horacio Blodek, sobrevolaron un área de más de 300 mil hectáreas sobre el Parque Provincial Moconá y la Reserva de Biósfera Yabotí, una zona del centro este de la provincia que “esta siendo impactada por la extracción ilegal de madera y la caza furtiva por parte de pobladores que cruzan a la Argentina desde territorio brasileño” dijeron. Ambos funcionarios se pusieron el traje de comentaristas si encontrar alguna solución creíble para las organizaciones. La extracción ilegal de madera y la caza furtiva, están terminando con los parques provinciales de Misiones que parece no encontrar una solución de ordenamiento en la gestión pública.